RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 OLFM3Q96PB7 478 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 MCF2LO15068 1137 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ATG16L1Q676U5 607 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SHC3Q92529 594 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 PTPRN2Q92932 1015 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 BORCS6Q96GS4 357 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 WWP1Q9H0M0 922 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.08■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 NLRX1Q86UT6 975 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 NRG4Q8WWG1 115 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 E2F7Q96AV8 911 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.62e-8■■■■■ 42.5
PACS2-201ENST00000325438 SCINQ9Y6U3 715 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 KRT37O76014 449 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 GLRA2P23416 452 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 MOGSQ13724 837 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ICA1LQ8NDH6 482 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 NGLY1Q96IV0 654 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 RPS6KA4O75676 772 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ZMPSTE24O75844 475 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 GCNAQ96QF7 691 aa25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TCF4P15884 667 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SAT1P21673 171 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CRKP46108 304 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 OSTNP61366 133 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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PACS2-201ENST00000325438 ZNF212Q9UDV6 495 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 FAM155BO75949 473 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SNHG28P0DPA3 235 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TRPC3Q13507 836 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SH2D4BQ5SQS7 431 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TMEM165Q9HC07 324 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 GALNT8Q9NY28 637 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 APPL1Q9UKG1 709 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ADCY3O60266 1144 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 HLA-DRAP01903 254 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CYP3A7P24462 503 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 IVDP26440 423 aa25.06■■□□□ 1.6
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PACS2-201ENST00000325438 NXNQ6DKJ4 435 aa25.06■■□□□ 1.6
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PACS2-201ENST00000325438 MTHFD1LQ6UB35 978 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
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PACS2-201ENST00000325438 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 PPP4R1Q8TF05 950 aa25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ELK3P41970 407 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 PDE1BQ01064 536 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CNPY1Q3B7I2 92 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 NDUFAF2Q8N183 169 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 NENFQ9UMX5 172 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SERPINB2P05120 415 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CYP3A4P08684 503 aa25.05■■□□□ 1.6
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PACS2-201ENST00000325438 CD101Q93033 1021 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa25.05■■□□□ 1.6
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PACS2-201ENST00000325438 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 RAB6BQ9NRW1 208 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 APRTP07741 180 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 FDX1P10109 184 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 RBP3P10745 1247 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ANKRD22Q5VYY1 191 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 ZBTB33Q86T24 672 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 TAF1P21675 1872 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PACS2-201ENST00000325438 CFHP08603 1231 aa25.04■■□□□ 1.6
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