RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 LTBP1Q14766 1721 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GDF10P55107 478 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARL4CP56559 192 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 LDHDQ86WU2 507 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC17Q96AE7 1141 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS11Q9H270 941 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYNLT1P63172 113 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 E5RJQ4 531 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYL2P10916 166 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PGM1P36871 562 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXL18Q96ME1 805 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 NMUR2Q9GZQ4 415 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K7O43318 606 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPINB4P48594 390 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF677Q86XU0 584 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZFAND2BQ8WV99 257 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM161BQ96MY7 647 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 KAT6AQ92794 2004 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FCHO1O14526 889 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RARBP10826 455 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNA15P30679 374 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASA2Q15283 850 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 CSRNP1Q96S65 589 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEA13PA6NCF6 341 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 LPXNO60711 386 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPT1BQ92523 772 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERAC1Q96JX3 654 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TM9SF1O15321 606 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 HLA-DRAP01903 254 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 OGDHQ02218 1023 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 BBS9Q3SYG4 887 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPD1LQ8N335 351 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 B2RBV5 119 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC6O75061 913 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNNI1P19237 187 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTF2H1P32780 548 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TKFCQ3LXA3 575 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHRS4Q9BTZ2 278 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACSS3Q9H6R3 686 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GINM1Q9NU53 330 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPRJQ12913 1337 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 H3BRJ5 948 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFIBO00712 420 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRLP54845 237 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMC5P62195 406 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR44Q5JSH3 913 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms