RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 ACBD6Q9BR61 282 aa21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-201ENST00000303927 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-201ENST00000303927 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-201ENST00000303927 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3-201ENST00000303927 MTMR11A4FU01 709 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 GABRDO14764 452 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM163BP0C2L3 166 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PLD1Q13393 1074 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF699Q32M78 642 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SV2AQ7L0J3 742 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM209Q96SK2 561 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 MMS19Q96T76 1030 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 STX10O60499 249 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PCSK1P29120 753 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 GTF2H1P32780 548 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 GPC5P78333 572 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ELMOD1Q8N336 334 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PJA1Q8NG27 643 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 NELFBQ8WX92 580 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TAF4BQ92750 862 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 CEP63Q96MT8 703 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 NOTCH4Q99466 2003 aa21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TACC1O75410 805 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 CLSTN1O94985 981 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 VNN1O95497 513 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 VNN2O95498 520 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM49P0CI25 452 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM49CP0CI26 452 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 DUSP4Q13115 394 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PAK1Q13153 545 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ING5Q8WYH8 240 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 FOXQ1Q9C009 403 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 YIPF1Q9Y548 306 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 COL4A3Q01955 1670 aa21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 P4HA1P13674 534 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PTPN2P17706 415 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PIK3CAP42336 1068 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 GCLMP48507 274 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TWF1Q12792 350 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 IQCEQ6IPM2 695 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TTI2Q6NXR4 508 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 OSTM1Q86WC4 334 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SHDQ96IW2 340 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 KXD1Q9BQD3 176 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 HLA-DRAP01903 254 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ALDH1A3P47895 512 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 EPHB3P54753 998 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 STARD6P59095 220 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PPP3CAQ08209 521 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 KRT39Q6A163 491 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SNX25Q9H3E2 840 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 CDH9Q9ULB4 789 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 RHOP08100 348 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 MXI1P50539 228 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 LEMD2Q8NC56 503 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3-201ENST00000303927 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms