RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CSDE1-201ENST00000261443 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.57□□□□□ -1.2
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