RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219084.10

CHD9-201, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHD9, Length 8,739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9-201ENST00000219084 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 GANQ9H2C0 597 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 STMN3Q9NZ72 180 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 SELENONQ9NZV5 590 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 PDHBP11177 359 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 GPD1P21695 349 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 TP53BP2Q13625 1128 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 DSEQ9UL01 958 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 SLC29A2Q14542 456 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 DDIASQ8IXT1 998 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 ZNF185O15231 689 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 TLR2O60603 784 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 RBP1P09455 135 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 ALADP13716 330 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 MTF1Q14872 753 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 CHST13Q8NET6 341 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 MS4A14Q96JA4 679 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 MCEEQ96PE7 176 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 TBX20Q9UMR3 447 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 MYMKA6NI61 221 aa4.59□□□□□ -1.67
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CHD9-201ENST00000219084 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 IER5Q5VY09 327 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 NUP98P52948 1817 aa4.59□□□□□ -1.67
CHD9-201ENST00000219084 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L15C9J2P7 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L11C9JVI0 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L18D6R9N7 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L22D6RA61 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L19D6RCP7 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 USP17L20D6RJB6 530 aa4.59□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 F5H6K3 240 aa4.59□□□□□ -1.68
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