RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)L

tK(UUU)L, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)L, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)LtK(UUU)L ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L HAM1P47119 197 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L BUL1P48524 976 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPA14P50106 137 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RIB4P50861 169 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YIP3P53633 176 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L STP4Q07351 490 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L POC4Q12245 148 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L PRR2Q12310 699 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YOR011W-AQ3E807 68 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L COA2Q3E823 68 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YHR213WP0CI67 198 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L GCN3P14741 305 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MLF3P32047 452 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SHB17P36136 271 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L VMA22P38784 181 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MST28P39552 234 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YER137CP40083 148 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SIM1P40472 476 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SNX4P47057 423 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MST27P53176 234 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YGR018CP53211 109 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L HST4P53688 370 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MRPL50P53724 139 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MRX11Q03079 207 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L IZH1Q03419 316 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L ANT1Q06497 328 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L ARR3Q06598 404 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YLR125WQ12138 136 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L POM34Q12445 299 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YCR075W-AQ3E830 75 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YMR316C-AI2HB70 103 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L CKS1P20486 150 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YCR025CP25352 136 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L PPQ1P32945 549 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01not detected
tK(UUU)LtK(UUU)L DER1P38307 211 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SNU13P39990 126 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YGR269WP40326 108 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YIL077CP40508 320 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SMD3P43321 101 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L ATG27P46989 271 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L TAD2P47058 250 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MIC26P50087 233 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YCL001W-AP87012 153 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SGF11Q03067 99 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L VAM10Q08474 114 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L AYT1Q12226 474 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L ERV2Q12284 196 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L CPT1P17898 393 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L AUA1P32450 94 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YBL059WP34224 193 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L PET100P38958 111 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L GCV3P39726 170 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SPC25P40014 221 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YER135CP40082 130 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L EMC5P40540 141 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YJR096WP47137 282 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YJR111CP47148 283 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YDL242WQ07746 117 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YOL160WQ08321 113 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L ATX2Q12067 313 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YPR013CQ12145 317 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L TY1A-BRQ12217 440 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L HTB2P02294 131 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MRS1P07266 363 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SPO13P23624 291 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L CDC50P25656 391 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L HMX1P32339 317 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L AFR1P33304 620 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L SRL3P36167 246 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MBB1P39534 108 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L KEG1P43614 200 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L IMP2P46972 177 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L COX16P47081 118 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YGL117WP53133 265 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L FMP41P53889 259 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L HAL1Q01766 294 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L MRPS8Q03799 155 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L PLP1Q04004 230 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L YMR244WQ04018 355 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L ORM2Q06144 216 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L CTR3Q06686 241 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L CCW12Q12127 133 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L USV1Q12132 391 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L PRM7Q12459 698 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L TAR1Q8TGM6 124 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)LtK(UUU)L RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms