RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D HAM1P47119 197 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D BUL1P48524 976 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPA14P50106 137 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RIB4P50861 169 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YIP3P53633 176 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D STP4Q07351 490 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D POC4Q12245 148 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D PRR2Q12310 699 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YOR011W-AQ3E807 68 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D COA2Q3E823 68 aa2.51□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR213WP0CI67 198 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D GCN3P14741 305 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MLF3P32047 452 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SHB17P36136 271 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D VMA22P38784 181 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MST28P39552 234 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YER137CP40083 148 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SIM1P40472 476 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SNX4P47057 423 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MST27P53176 234 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR018CP53211 109 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D HST4P53688 370 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPL50P53724 139 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MRX11Q03079 207 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D IZH1Q03419 316 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D ANT1Q06497 328 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D ARR3Q06598 404 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR125WQ12138 136 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D POM34Q12445 299 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YCR075W-AQ3E830 75 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.5□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR316C-AI2HB70 103 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D CKS1P20486 150 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YCR025CP25352 136 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D PPQ1P32945 549 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D DER1P38307 211 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SNU13P39990 126 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR269WP40326 108 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YIL077CP40508 320 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SMD3P43321 101 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D ATG27P46989 271 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D TAD2P47058 250 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MIC26P50087 233 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YCL001W-AP87012 153 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SGF11Q03067 99 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D VAM10Q08474 114 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D AYT1Q12226 474 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D ERV2Q12284 196 aa2.49□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D CPT1P17898 393 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D AUA1P32450 94 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YBL059WP34224 193 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D PET100P38958 111 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D GCV3P39726 170 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SPC25P40014 221 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YER135CP40082 130 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D EMC5P40540 141 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YJR096WP47137 282 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YJR111CP47148 283 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YDL242WQ07746 117 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YOL160WQ08321 113 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D ATX2Q12067 313 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YPR013CQ12145 317 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1A-BRQ12217 440 aa2.48□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D HTB2P02294 131 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MRS1P07266 363 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SPO13P23624 291 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D CDC50P25656 391 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D HMX1P32339 317 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D AFR1P33304 620 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D SRL3P36167 246 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MBB1P39534 108 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D KEG1P43614 200 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D IMP2P46972 177 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D COX16P47081 118 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YGL117WP53133 265 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D FMP41P53889 259 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D HAL1Q01766 294 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPS8Q03799 155 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D PLP1Q04004 230 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR244WQ04018 355 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D ORM2Q06144 216 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D CTR3Q06686 241 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D CCW12Q12127 133 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D USV1Q12132 391 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D PRM7Q12459 698 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D TAR1Q8TGM6 124 aa2.47□□□□□ -2.01
tK(UUU)DtK(UUU)D RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41 ms