RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	YGR018C	P53211	109 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	ADD37	Q03233	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	YMR007W	Q03675	126 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	MSA1	Q08471	629 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	SPO13	P23624	291 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	YBL059W	P34224	193 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	BNA1	P47096	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	SRB7	P47822	140 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	SNN1	P48232	102 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	UBC12	P52491	188 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	ODC1	Q03028	310 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	AVO2	Q04749	426 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	CTR3	Q06686	241 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	POS5	Q06892	414 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PPQ1	YPL179W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YCR022C	P25620	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	INO2	P26798	304 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	FIP1	P45976	327 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YNR066C	P53752	436 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	COX19	Q3E731	98 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	BDH1	P39714	382 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	ERG25	P53045	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	LST7	P53237	242 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	BOR1	P53838	576 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SHH3	Q04487	196 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	ZRC1	P20107	442 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YBL071C	P38185	102 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	DER1	P38307	211 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	GLE2	P40066	365 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	ATG27	P46989	271 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	VPS55	P47111	140 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	MCM22	P47167	239 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SPG4	Q04438	115 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RAD28	Q12021	506 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CDC7	P06243	507 aa		3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	MSK1	P32048	576 aa		3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	AVT5	P38176	459 aa		3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SPC25	P40014	221 aa		3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	DSK2	P48510	373 aa		3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	MIC27	P50945	234 aa		3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
PPQ1	YPL179W	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	QCR9	P22289	66 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CSH1	P38287	376 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YBR292C	P38357	123 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	DOG2	P38773	246 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	DOG1	P38774	246 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	AGE2	P40529	298 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YGR219W	P53307	113 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CPD1	P53314	239 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	TMA23	Q03525	211 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	HOR7	Q05827	59 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YPR013C	Q12145	317 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	AYT1	Q12226	474 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YFL068W	P0CX99	160 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	FPR2	P32472	135 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RRT1	P38192	103 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	TRS20	P38334	175 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	PET100	P38958	111 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	HUA1	P40325	198 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	TOS8	P53147	276 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YGR025W	P53216	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SNO1	Q03144	224 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	YLR281C	Q05863	155 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	CYC3	P06182	269 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PPQ1	YPL179W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93

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