RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	YIL169C	P40442	995 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	CRH1	P53301	507 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RCE1	Q03530	315 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YFH1	Q07540	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	POM33	Q12164	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YPS3	Q12303	508 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MSI1	P13712	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	SRP21	P32342	167 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	SPS18	P32572	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	TCA17	P32613	152 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YKL102C	P34249	101 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YMR262W	P38430	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	PCL7	P40186	285 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	HIT1	P46973	164 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YIP5	P53108	310 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	SAE3	P89114	91 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MIX14	Q04341	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	AKR2	Q12013	749 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MDM10	P18409	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YMR31	P19955	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	ROX3	P25046	220 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YGL010W	P25338	174 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	ATG15	P25641	520 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPB11	P38902	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	GAT2	P40209	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	GLC8	P41818	229 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	EGT2	P42835	1041 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	BOR1	P53838	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MRP51	Q02950	344 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	NAT3	Q06504	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	LOA1	Q06508	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	VPS63	O13549	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	HMX1	P32339	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	DER1	P38307	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	CUE1	P38428	203 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	VHS2	P40463	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	ECO1	P43605	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	RPN14	P53196	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	MCH1	Q07376	486 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	LDS2	Q08218	356 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	FIT3	Q08907	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSH1	YOL054W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	DAD2	P36162	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	MRPL39	P36533	70 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SRP14	P38985	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	CPD1	P53314	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YKL187C	P34231	750 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PAU16	P35994	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	UTH1	P36135	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	XPT1	P47165	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	MIC27	P50945	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	WSC2	P53832	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	HSK3	P69852	69 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	STD1	Q02794	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SHH3	Q04487	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	LIP2	Q06005	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	QRI5	P32344	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	FPR2	P32472	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	MRPS5	P33759	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	MIX23	P38162	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YER084W	P40057	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	DFG10	P40526	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SAS2	P40963	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RPA43	P46669	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YJR015W	P47090	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	DSK2	P48510	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	DYN2	Q02647	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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