RNA–Protein interactions for RNA: Q0120

BI4, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI4	Q0120	RAD6	P06104	172 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YEL028W	P39989	153 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	POG1	P40473	351 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	TIM13	P53299	105 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	KEI1	Q06346	221 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	RIF1	P29539	1916 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	HFA1	P32874	2273 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	MOB1	P40484	314 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YDL157C	Q12082	118 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	PEX11	Q12462	236 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YGR269W	P40326	108 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YIP3	P53633	176 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	FCY1	Q12178	158 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YML079W	Q03629	201 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	TRM3	Q07527	1436 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YCR001W	P25347	104 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	TMA23	Q03525	211 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	SYM1	Q06563	197 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	YDL241W	Q07738	123 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	XPT1	P47165	209 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	GIM3	P53900	129 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	THI74	Q04083	370 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	HRD1	Q08109	551 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BI4	Q0120	SPS2	P08459	502 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	KIN28	P06242	306 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	NUF2	P33895	451 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	RAD51	P25454	400 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	HSK3	P69852	69 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	LIP1	Q03579	150 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	INO4	P13902	151 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	TAF2	P23255	1407 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	SRP14	P38985	146 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	HHY1	P39982	102 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	GEP7	P53171	287 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	PLP1	Q04004	230 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	YPR114W	Q06107	315 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	ATG10	Q07879	167 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	SPT14	P32363	452 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	PTC1	P35182	281 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	YBR027C	P38220	110 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	CIN5	P40917	295 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	UIP4	Q08926	304 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	GLC8	P41818	229 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	YNL140C	P53910	189 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	APS3	P47064	194 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	YDR102C	Q03864	110 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BI4	Q0120	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	HSP150	P32478	413 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YEL014C	P39999	101 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	VAM10	Q08474	114 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	CCC1	P47818	322 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YNR064C	P53750	290 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YGL101W	P53144	215 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	ATP5	P09457	212 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	MRS4	P23500	304 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.43	□□□□□ -2.34	not detected
BI4	Q0120	ORM1	P53224	222 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YLR046C	Q12253	270 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	SED1	Q01589	338 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	IPT1	P38954	527 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	YER121W	P40076	114 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	MGR2	Q02889	113 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
BI4	Q0120	ECM31	P38122	312 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	GIM5	Q04493	163 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	RDI1	Q12434	202 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	FMN1	Q03778	218 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	PRM3	Q08931	133 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	RIB3	Q99258	208 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	HAP2	P06774	265 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
BI4	Q0120	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35

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