RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 SAT1P21673 171 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TNFSF9P41273 254 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CYP24A1Q07973 514 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ABI1Q8IZP0 508 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CFAP36Q96G28 342 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 MYH1P12882 1939 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 ABCA3Q99758 1704 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 H0Y3Z8 333 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PGK1P00558 417 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RFX1P22670 979 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SP2Q02086 613 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CCNYQ8ND76 341 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SNF8Q96H20 258 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RILPQ96NA2 401 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SCINQ9Y6U3 715 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TJP3O95049 919 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.54□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.54□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TMEM120BA0PK00 339 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RPS6KA5O75582 802 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TRPA1O75762 1119 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 UPP2O95045 317 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 LCP1P13796 627 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PTENP60484 403 aa9.54□□□□□ -0.88
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