RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZS52 159 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 BPIFB1Q8TDL5 484 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 K7ESF4 209 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R37O75864 691 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 ADSSP30520 456 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 USP49Q70CQ1 688 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 GIPC2Q8TF65 315 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 POMGNT1Q8WZA1 660 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 HVCN1Q96D96 273 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 EPSTI1Q96J88 318 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 GCNAQ96QF7 691 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SLC46A2Q9BY10 475 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 HRO43593 1189 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 RETP07949 1114 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 FNTBP49356 437 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 TNK2Q07912 1038 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SPEM2Q0P670 501 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 CCINQ13939 588 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 POSTNQ15063 836 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 TAF12Q16514 161 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 DYMQ7RTS9 669 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SFR1Q86XK3 245 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 NT5DC4Q86YG4 428 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 STRA6Q9BX79 667 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 KPNA7A9QM74 516 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 IL18RAPO95256 599 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 CNR2P34972 360 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 PON2Q15165 354 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SV2CQ496J9 727 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 LONP2Q86WA8 852 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.89■■□□□ 1.9
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PTPRF-216ENST00000617451 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 ZMYM5Q9UJ78 669 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 LRP3O75074 770 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM150AQ86TG1 271 aa26.88■■□□□ 1.89
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PTPRF-216ENST00000617451 RTKNQ9BST9 563 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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PTPRF-216ENST00000617451 STK17AQ9UEE5 414 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 CLIC4Q9Y696 253 aa26.88■■□□□ 1.89
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PTPRF-216ENST00000617451 HOXA6P31267 233 aa26.87■■□□□ 1.89
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PTPRF-216ENST00000617451 PTPAQ15257 358 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 F11P03951 625 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 PNPLA4P41247 253 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP12P59046 1061 aa26.86■■□□□ 1.89
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PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF560Q96MR9 790 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 FAM83CQ9BQN1 747 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 FAM213AQ9BRX8 229 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 GKN1Q9NS71 199 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 TCHHQ07283 1943 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 MYMKA6NI61 221 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 GAP43P17677 238 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 WNT7BP56706 349 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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PTPRF-216ENST00000617451 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.894e-6■■■■□ 24.4
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PTPRF-216ENST00000617451 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 TSPY1Q01534 308 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 BRSK2Q8IWQ3 736 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 MAB21L3Q8N8X9 362 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 ACCSQ96QU6 501 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 CCL26Q9Y258 94 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 HOXC13P31276 330 aa26.83■■□□□ 1.89
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