RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF233A6NK53 670 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CETN3O15182 167 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NCAM2O15394 837 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 B4GALT5O43286 388 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EXTL3O43909 919 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EXOC3O60645 756 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 IL18RAPO95256 599 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GNA14O95837 355 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EFEMP2O95967 443 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GALTP07902 379 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CEACAM1P13688 526 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PROZP22891 400 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KLRC2P26717 231 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CASP1P29466 404 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FNTBP49356 437 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PFKPQ01813 784 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PAK1Q13153 545 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MORC3Q14149 939 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 STX1AQ16623 288 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NFIL3Q16649 462 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HELQQ8TDG4 1101 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 LOXL4Q96JB6 756 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CDT1Q9H211 546 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PARP2Q9UGN5 583 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 IPPQ9Y573 584 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 BIN1O00499 593 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TEX28O15482 410 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 STX10O60499 249 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PRB1P04280 392 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TPM2P07951 284 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KRT13P13646 458 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PAX3P23760 479 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CCNE1P24864 410 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HOXC13P31276 330 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CCR3P51677 355 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CASP5P51878 434 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 AP3M2P53677 418 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NLRP12P59046 1061 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TPM4P67936 248 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ENPEPQ07075 957 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GRIK3Q13003 919 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RNF43Q68DV7 783 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 LONP2Q86WA8 852 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GPD1LQ8N335 351 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TCEAL3Q969E4 200 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HPS3Q969F9 1004 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 UROC1Q96N76 676 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FNBP1Q96RU3 617 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 APOL6Q9BWW8 343 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ASB7Q9H672 318 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CDH7Q9ULB5 785 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GDAQ9Y2T3 454 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 DERAQ9Y315 318 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 THADAQ6YHU6 1953 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NOTCH2Q04721 2471 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 LRRK2Q5S007 2527 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 AXIN1O15169 862 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MAPK13O15264 365 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms