RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBE4B	O95155	1302 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNNI1	P19237	187 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYK	P43405	635 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	EHHADH	Q08426	723 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TEAD2	Q15562	447 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989		R4GN57	208 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A1W2PRU2	124 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLRC4	O43908	158 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXOC3	O60645	756 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	MOSPD3	O75425	235 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDUFA8	P51970	172 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYL7	Q01449	175 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSPY1	Q01534	308 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	STK4	Q13043	487 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TAF12	Q16514	161 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ECI2	O75521	394 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	MICAL2	O94851	1124 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLSTN1	O94985	981 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPHA5	P54756	1037 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMD2	Q13200	908 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRM2	Q14416	872 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	HCRT	O43612	131 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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