RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM2P49736 904 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCB2Q00722 1185 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 RABEP1Q15276 862 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 CSRP2Q16527 193 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ADALQ6DHV7 355 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL23Q86XA0 190 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNAQ96QF7 691 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 IKZF4Q9H2S9 585 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF6P49848 677 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 WSCD1Q658N2 575 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PKN3Q6P5Z2 889 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 DPP3Q9NY33 737 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-211ENST00000590874 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.71■■■□□ 2.03
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CAPNS1-211ENST00000590874 GDF9O60383 454 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRB1P08588 477 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM150AQ86TG1 271 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB13Q8IY85 973 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 THEM5Q8N1Q8 247 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNPOQ8N3V7 929 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SPPL2BQ8TCT7 592 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP68Q76N32 757 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTM8Q8IZV2 173 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CHFRQ96EP1 664 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 GKN1Q9NS71 199 aa27.69■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 CCL26Q9Y258 94 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCD1P33897 745 aa27.68■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 STKLD1Q8NE28 680 aa27.68■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 HPS4Q9NQG7 708 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TMLHEQ9NVH6 421 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT37O76014 449 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP12P59046 1061 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 FSTL4Q6MZW2 842 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 MAB21L3Q8N8X9 362 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 F11P03951 625 aa27.66■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM196Q5HYL7 178 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SFR1Q86XK3 245 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 EBF3Q9H4W6 596 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN1AP35498 2009 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTBN2O15020 2390 aa27.66■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 WNT7BP56706 349 aa27.65■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 BMP15O95972 392 aa27.64■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC8Q6A555 127 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 DYMQ7RTS9 669 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-211ENST00000590874 AXIN1O15169 862 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R37O75864 691 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSAP15289 507 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
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CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC6Q16204 474 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 USP49Q70CQ1 688 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GAB3Q8WWW8 586 aa27.63■■■□□ 2.01
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