RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NNZ2 444 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 CTNNA2P26232 953 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBB8Q3ZCM7 444 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 ACAD10Q6JQN1 1059 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM72Q6ZMU5 477 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 FIBCD1Q8N539 461 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 ASAP3Q8TDY4 903 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 KAT5Q92993 513 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 RUNDC3BQ96NL0 473 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB18PQ96TA0 734 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG6Q9Y672 507 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-204ENST00000587718 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0B4J269 797 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 DGKIO75912 1065 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 GGCXP38435 758 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 USP8P40818 1118 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CARSP49589 748 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CDHR5Q9HBB8 845 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM114A2Q9NRY5 505 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC3P53804 2025 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM187AA6NFU0 413 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 C22orf31O95567 290 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 PTENP60484 403 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 GPM6BQ13491 265 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 SURF1Q15526 300 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDYCQ5MJ68 293 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC45Q96CN5 670 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CGRRF1Q99675 332 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYND15Q9H091 742 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLPH3Q9H4A6 298 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS6KA5O75582 802 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 GBP1P32455 592 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC47A2Q86VL8 602 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAAF5Q86Y56 855 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 RUFY1Q96T51 708 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSWIM1Q9BR11 485 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB17Q9H0T7 212 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 DLATP10515 647 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 BMPR1AP36894 532 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCKQ8N0W5 287 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 NFU1Q9UMS0 254 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTN6Q9UQ52 1028 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRIQ4A6NIV6 560 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 RB1P06400 928 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPROQ16827 1216 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF3Q5VWG9 929 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 LRIG3Q6UXM1 1119 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CD101Q93033 1021 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM143Q96AN5 459 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DRAP01903 254 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 FGGP02679 453 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MMEP08473 750 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 DRG2P55039 364 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP58Q5T655 872 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF516Q92618 1163 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 PLVAPQ9BX97 442 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM204AQ9H8W3 233 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR3Q13615 1198 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT81Q8WYA0 676 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TATDN2Q93075 761 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 VCPIP1Q96JH7 1222 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MSTO1Q9BUK6 570 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM129AQ9BZQ8 928 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR32O75388 356 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 TNNI1P19237 187 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms