RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNK	Q9P0W0	207 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	C4A	P0C0L4	1744 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	C4B	P0C0L5	1744 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	XDH	P47989	1333 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC12A8	A0AV02	714 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPY2	A6NKD2	308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF28P	B7ZC32	967 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKAB2	O43741	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SCG2	P13521	617 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	GNA11	P29992	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	GYG1	P46976	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	NLRP5	P59047	1200 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM193A	P78312	1265 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MECOM	Q03112	1051 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TROAP	Q12815	778 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	GRAP	Q13588	217 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MOGS	Q13724	837 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MORC3	Q14149	939 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA1	Q5VX52	437 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZSN1	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA20	Q8TB22	786 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CFHR4	Q92496	578 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MKL1	Q969V6	931 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCD	Q96DY2	449 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CABP5	Q9NP86	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	NRAP	Q86VF7	1730 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH6	P13533	1939 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289		H7C1D1	291 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC26A4	O43511	780 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNQ2	O43526	872 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	RASGRP1	O95267	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBB	P07437	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	ACRV1	P26436	265 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PRPH	P41219	470 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	AMPD3	Q01432	767 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	HHEX	Q03014	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	RBL2	Q08999	1139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	ABHD18	Q0P651	414 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF10	Q13118	480 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	STIM1	Q13586	685 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM14	Q14142	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TM4SF20	Q53R12	229 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf60	Q5U649	245 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	HOMER1	Q86YM7	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	VSTM4	Q8IW00	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	DLG3	Q92796	817 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	AK8	Q96MA6	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PANX2	Q96RD6	677 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC7	Q99615	494 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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