RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NTMQ9P121 344 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM17Q9Y577 477 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 A0A088AWK7 358 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PSMD14O00487 310 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 C1QTNF9P0C862 333 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SYN1P17600 705 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SMARCA1P28370 1054 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MEOX1P50221 254 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HK3P52790 923 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 RAB1AP62820 205 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 KIF22Q14807 665 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HLFQ16534 295 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MST1LQ2TV78 715 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 C4orf46Q504U0 113 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SUSD4Q5VX71 490 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 KRT78Q8N1N4 520 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF480Q8WV37 535 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TMX3Q96JJ7 454 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PPCSQ9HAB8 311 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GGA3Q9NZ52 723 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SCN7AQ01118 1682 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 C2orf78A6NCI8 922 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 NTSR2O95665 410 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CSF2RBP32927 897 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 STK3Q13188 491 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RAB39AQ14964 217 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PCOLCEQ15113 449 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 DPP9Q86TI2 863 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RAB24Q969Q5 203 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35A4Q96G79 324 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TLR9Q9NR96 1032 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ABCC4O15439 1325 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PPL8 197 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RASA4BC9J798 803 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ADM5C9JUS6 153 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RASA4O43374 803 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ECE2O60344 883 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TCEA3O75764 348 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 GPTP24298 496 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 HOXD10P28358 340 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SP3Q02447 781 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 BTKQ06187 659 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ADAM15Q13444 863 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 APOA5Q6Q788 366 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZVL8 140 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CARFQ8N187 725 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MBD6Q96DN6 1003 aa6.45□□□□□ -1.38
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