RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PQ27 194 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PQ64 194 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PQC6 194 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PQD8 194 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 C4orf47A7E2U8 309 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NUDT19A8MXV4 375 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 N4BP3O15049 544 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 BMP7P18075 431 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 EDNRBP24530 442 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 FNTBP49356 437 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 STAT2P52630 851 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ADCY1Q08828 1119 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PAK2Q13177 524 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LETM2Q2VYF4 491 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 C12orf60Q5U649 245 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SLFN13Q68D06 897 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TMC6Q7Z403 805 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 GPR149Q86SP6 731 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CABP7Q86V35 215 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF843Q8N446 348 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 GPR20Q99678 358 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CWH43Q9H720 699 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NYAP2Q9P242 653 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 APC2O95996 2303 aa5.22□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NUP205Q92621 2012 aa5.21□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 SRGAP3O43295 1099 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CXCL14O95715 111 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CHGBP05060 677 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF806P0C7X5 589 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 FGFR1P11362 822 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ITGA4P13612 1032 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 MCCP23508 829 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 HOXC8P31273 242 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CDR1P51861 262 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 MGAT3Q09327 533 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 SCAPQ12770 1279 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 JAMLQ86YT9 394 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CERS3Q8IU89 383 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 MZB1Q8WU39 189 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CEP95Q96GE4 821 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CLMPQ9H6B4 373 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 FHOD1Q9Y613 1164 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ATMQ13315 3056 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 MYH6P13533 1939 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CACNA1EQ15878 2313 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 PRDM1O75626 825 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 ICAM1P05362 532 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 CD3EP07766 207 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 STAG3L1P0CL83 205 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 SCG2P13521 617 aa5.2□□□□□ -1.58
TMOD3-210ENST00000561408 HOXA5P20719 270 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms