RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 JADE1Q6IE81 842 aa16.02■□□□□ 0.16
LRP1-211ENST00000556356 USP33Q8TEY7 942 aa16.02■□□□□ 0.16
LRP1-211ENST00000556356 RAPGEF5Q92565 580 aa16.02■□□□□ 0.16
LRP1-211ENST00000556356 C12orf42Q96LP6 360 aa16.02■□□□□ 0.16
LRP1-211ENST00000556356 RIPK3Q9Y572 518 aa16.02■□□□□ 0.16
LRP1-211ENST00000556356 UNCXA6NJT0 531 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MAP3K7CLP57077 242 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 KCNK18Q7Z418 384 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TTC8Q8TAM2 541 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RECQL4O94761 1208 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CHEK2O96017 543 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SETSIPP0DME0 302 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 COMTP21964 271 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ARHGAP25P42331 645 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MIB1Q86YT6 1006 aa16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CCL23P55773 120 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GAD1Q99259 594 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 BTBD7Q9P203 1132 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 F5H5T6 163 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 H0Y626 953 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 AVPR1AP37288 418 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MSRAQ9UJ68 235 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SNX2O60749 519 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SNX12Q9UMY4 172 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MTSS1O43312 755 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ATP9BO43861 1147 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MMEP08473 750 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CCT5P48643 541 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 UCMAQ8WVF2 138 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 EPHB2P29323 1055 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ABRAQ8N0Z2 381 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ATP11CQ8NB49 1132 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 USP20Q9Y2K6 914 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ALG6Q9Y672 507 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 LAMB3Q13751 1172 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 KRT35Q92764 455 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 COPEO14579 308 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MMEL1Q495T6 779 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FIGNQ5HY92 759 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RASSF3Q86WH2 238 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PPM1NQ8N819 430 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ARHGAP42A6NI28 874 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MMP3P08254 477 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MYL4P12829 197 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ARHGEF7Q14155 803 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ZBED8Q8IZ13 594 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 COL1A2P08123 1366 aa16■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 KPNA7A9QM74 516 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ITGA7Q13683 1181 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 UROC1Q96N76 676 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ZNF558Q96NG5 402 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 AGAP3Q96P47 875 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ABCB6Q9NP58 842 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms