RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 A0A087X1B8 175 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ALG1L2C9J202 215 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 AMY1AP04745 511 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 SPATA31D3P0C874 917 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 KRT4P19013 534 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 PCSK1P29120 753 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 WASP42768 502 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ALDH1A3P47895 512 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ITPK1Q13572 414 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 NEU1Q99519 415 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 MYOCQ99972 504 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 TTPALQ9BTX7 342 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 SHTN1A0MZ66 631 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 GABRDO14764 452 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 LPXNO60711 386 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 GPR32O75388 356 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 HLA-DOAP06340 250 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 GYS1P13807 737 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 C5AR1P21730 350 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 DDR1Q08345 913 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF529Q6P280 563 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 DRC7Q8IY82 874 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 LTN1O94822 1766 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-218ENST00000553309 TEX33O43247 280 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 RAMP2O60895 175 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 DDCP20711 480 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 BMPR1AP36894 532 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 CNTROBQ8N137 903 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SLC6A2P23975 617 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SLC16A1P53985 500 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 RESTQ13127 1097 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 MTM1Q13496 603 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 PIGBQ92521 554 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 DKK2Q9UBU2 259 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 COL4A3Q01955 1670 aa6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 TNKSO95271 1327 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 SUV39H1O43463 412 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 CA12O43570 354 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 PRSS23O95084 383 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 CCND1P24385 295 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 RFC4P35249 363 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 ATP8B2P98198 1209 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 CREMQ03060 361 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 PTPN21Q16825 1174 aa6.25□□□□□ -1.41
ATXN3-218ENST00000553309 RSPH3Q86UC2 560 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms