RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC30A4	O14863	429 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAK2	O60296	914 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	GDF9	O60383	454 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT37	O76014	449 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF19	O95750	216 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ADRB1	P08588	477 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	PLCG1	P19174	1290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	GJB2	P29033	226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	WEE1	P30291	646 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CNR2	P34972	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	MCM6	Q14566	821 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CSRP2	Q16527	193 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	AK8	Q96MA6	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	DERA	Q9Y315	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CYB561D2	O14569	222 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	EXTL3	O43909	919 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	SCP2	P22307	547 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	PAX3	P23760	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC25C	P30307	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	UBA7	P41226	1012 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	MCM2	P49736	904 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF2B	Q00403	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	PPM1J	Q5JR12	505 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	RAD54L	Q92698	747 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ASB7	Q9H672	318 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931		H3BQV1	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC26A4	O43511	780 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXA6	P31267	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TAF6	P49848	677 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP68	Q76N32	757 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	DSE	Q9UL01	958 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LETMD1-231	ENST00000551931	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	F11	P03951	625 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR15	P49685	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	WNT7B	P56706	349 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	NLRP12	P59046	1061 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	RABEP1	Q15276	862 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC6	Q16204	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TAF12	Q16514	161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ADSS	P30520	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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