RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 BPTFQ12830 3046 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 TCHHQ07283 1943 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MTMR11A4FU01 709 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 SOAT2O75908 522 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ALDH1A2O94788 518 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 DEXIO95424 95 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 KCNE1P15382 129 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 PTGER3P43115 390 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 EFNA5P52803 228 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 VEPH1Q14D04 833 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 PPP2R5AQ15172 486 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF605Q86T29 641 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 CEP76Q8TAP6 659 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 RLN3Q8WXF3 142 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ACAP3Q96P50 834 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 FSCN3Q9NQT6 498 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 TDP1Q9NUW8 608 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 KNTC1P50748 2209 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.1□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 M0QZQ0 153 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 SERPINF2P08697 491 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 CD59P13987 128 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 PLA2G2AP14555 144 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 HOXD12P35452 270 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 P2RY2P41231 377 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MYBPC2Q14324 1141 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 C2orf27AQ580R0 203 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 USP33Q8TEY7 942 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 IFT74Q96LB3 600 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 FNBP1Q96RU3 617 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 CDT1Q9H211 546 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ECT2Q9H8V3 914 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 IL21Q9HBE4 155 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 CNTN3Q9P232 1028 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 CCL26Q9Y258 94 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.09□□□□□ -0.63
KDM5A-211ENST00000544777 K7ERI5 159 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 SH3BP5O60239 455 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 C1QL1O75973 258 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 ITPKAP23677 461 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 HSPA4P34932 840 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 SEC13P55735 322 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 NR1H3Q13133 447 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 CRY1Q16526 586 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 WHAMMQ8TF30 809 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 CRELD1Q96HD1 420 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 AIFM3Q96NN9 605 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 DKK4Q9UBT3 224 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 MYH11P35749 1972 aa11.08□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 ARHGAP33O14559 1287 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 CPLX1O14810 134 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 SYPP08247 313 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 CYP11B2P19099 503 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 IFNAR2P48551 515 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 SLC14A1Q13336 389 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.07□□□□□ -0.64
KDM5A-211ENST00000544777 PADI6Q6TGC4 694 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms