RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544550.5

SNHG1-220, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-220	ENST00000544550	C8A	P07357	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MYB	P10242	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CHRNB1	P11230	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SPINK2	P20155	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	OR1G1	P47890	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DNM2	P50570	870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	NLRP12	P59046	1061 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TRDN	Q13061	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	UBXN4	Q92575	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LPP	Q93052	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	NKD1	Q969G9	470 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DLGAP3	O95886	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	EFEMP2	O95967	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CCNE2	O96020	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	POMC	P01189	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PSMC3	P17980	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FGFR4	P22455	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TXK	P42681	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GNAQ	P50148	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RAC1	P63000	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TROAP	Q12815	778 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SEC23A	Q15436	765 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ELF2	Q15723	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CCDC6	Q16204	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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