RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	TRIAP1	O43715	76 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	FDXR	P22570	491 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	PEX2	P28328	305 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	AVPR1B	P47901	424 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFV1	P49821	464 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	UCP3	P55916	312 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	SCAP	Q12770	1279 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	FHL2	Q14192	279 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	GALE	Q14376	348 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	IQCB1	Q15051	598 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	MPP5	Q8N3R9	675 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	SLC15A4	Q8N697	577 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	XPR1	Q9UBH6	696 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	FAM50B	Q9Y247	325 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		5.59	□□□□□ -1.51
MDM2-231	ENST00000544125	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0B4J269	797 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ISM1	B1AKI9	464 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	MYO1F	O00160	1098 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TBX3	O15119	743 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	FRS3	O43559	492 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	PRC1	O43663	620 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	HKR1	P10072	659 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SLC11A2	P49281	568 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ARFIP2	P53365	341 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SATB1	Q01826	763 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TAP1	Q03518	808 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	FSTL1	Q12841	308 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	KLF10	Q13118	480 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CTBP1	Q13363	440 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TUBB3	Q13509	450 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	RAB32	Q13637	225 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC181	Q5TID7	509 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SSH3	Q8TE77	659 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	APIP	Q96GX9	242 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	PRRX2	Q99811	253 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.58	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CAND2	O75155	1236 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	MYF5	P13349	255 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	GNAL	P38405	381 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CNGA2	Q16280	664 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	KSR2	Q6VAB6	950 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	LNX2	Q8N448	690 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	DPH1	Q9BZG8	443 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	DCLK1	O15075	740 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	PEX1	O43933	1283 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	RAMP2	O60895	175 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CYP2C9	P11712	490 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	CD6	P30203	668 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MDM2-231	ENST00000544125	VIPR2	P41587	438 aa		5.56	□□□□□ -1.52

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