RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF11P52732 1056 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT17Q04695 432 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SGO2Q562F6 1265 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PASD1Q8IV76 773 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf29Q8N999 325 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA18Q8TC71 538 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFAP2BQ92481 460 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GALT6Q96L58 329 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYT15Q9BQS2 421 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED10Q9BTT4 135 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTPALQ9BTX7 342 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDH9Q9ULB4 789 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NME7Q9Y5B8 376 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPFP49454 3210 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087X0T9 212 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM170AA1A519 330 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCHNA4D1U4 455 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.962e-10■■□□□ 13.8
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OAZ2O95190 189 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM228BP0C875 321 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYOGP15173 224 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGFR3P22607 806 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANXA13P27216 316 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADORA2BP29275 332 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTNNB1P35222 781 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPM1AP35813 382 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BMPR1AP36894 532 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGEA1P43355 309 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDR1P51861 262 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARPP19P56211 112 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT83P78385 493 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPY1Q01534 308 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMO1Q01740 532 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYP27A1Q02318 531 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNGA2Q16280 664 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC18A3Q16572 532 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP41Q3LFD5 358 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1328Q86T90 577 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBA3Q8TBC4 463 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GDF15Q99988 308 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACBD6Q9BR61 282 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DESI2Q9BSY9 194 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HESX1Q9UBX0 185 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01553A4QN01 128 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2CD2LO14523 706 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSCAN12O43309 604 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGF18O76093 207 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MICAL2O94851 1124 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFHP08603 1231 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC175P0C221 793 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC130P13994 396 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CA8P35219 290 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STILQ15468 1287 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTP2Q5QGT7 225 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAA35Q5VZE5 725 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms