RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	DSE	Q9UL01	958 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	HUS1	O60921	280 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRN2	O75325	713 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	AKAP3	O75969	853 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CFH	P08603	1231 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MYL4	P12829	197 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PAX3	P23760	479 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	FCAR	P24071	287 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PRCP	P42785	496 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MYL6	P60660	151 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CLDN10	P78369	228 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	RTL10	Q7L3V2	364 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1W2PRU2	124 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	BMP6	P22004	513 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	NR2F2	P24468	414 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	RAP1GAP	P47736	663 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	EPHA5	P54756	1037 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CDH8	P55286	799 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TEAD2	Q15562	447 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	NFIL3	Q16649	462 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PABPC1-222	ENST00000523555	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PDGFRB	P09619	1106 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	NPR3	P17342	541 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP2F1	P24903	491 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ALDH1A3	P47895	512 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	GPC5	P78333	572 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP4F8	P98187	520 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP3CA	Q08209	521 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PLD1	Q13393	1074 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	BIRC3	Q13489	604 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	DDR2	Q16832	855 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZACN	Q401N2	412 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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