RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBXO41Q8TF61 875 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SERINC4A6NH21 518 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABLIM3O94929 683 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 T-ENOLP0DO92 83 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TGFB3P10600 412 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP2C18P33260 490 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC5A3P53794 718 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF365Q70YC5 407 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CUL5Q93034 780 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRF1P14222 555 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NIM1KQ8IY84 436 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMIEQ8NEW7 156 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM136AQ96C01 138 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNM3Q9UQ16 869 aa4.74□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC43A1O75387 559 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SOAT2O75908 522 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SBK3P0C264 359 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RHDQ02161 417 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TOR2AQ5JU69 321 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POT1Q9NUX5 634 aa4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H3BNX3 289 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANXA1P04083 346 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP4F2P78329 520 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C10orf25Q5T742 122 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP7Q93009 1102 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WBP1Q96G27 269 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RITA1Q96K30 269 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SQORQ9Y6N5 450 aa4.72□□□□□ -1.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCHO1O14526 889 aa4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DSCR3O14972 297 aa4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP1O94782 785 aa4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RSPH3Q86UC2 560 aa4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BPIP17213 487 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITGALP20701 1170 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD6P30203 668 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DUSP22Q9NRW4 184 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.7□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H7C1Q1 480 aa4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIM3Q86V86 326 aa4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOMER1Q86YM7 354 aa4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMX3Q96JJ7 454 aa4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.69□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.68□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZEB2O60315 1214 aa4.68□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLR5O60602 858 aa4.68□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GAS8-AS1O95177 125 aa4.68□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NPSP0C0P6 89 aa4.68□□□□□ -1.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms