RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CDH8P55286 799 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DMTNQ08495 405 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 C18orf8Q96DM3 657 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZIM3Q96PE6 472 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC19Q9H756 370 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DPP3Q9NY33 737 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DERAQ9Y315 318 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PODXLO00592 558 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 OPA1O60313 960 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NPTXRO95502 500 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PSEN2P49810 448 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GYS2P54840 703 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RBP5P82980 135 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TAP1Q03518 808 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HIC1Q14526 733 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TTC27Q6P3X3 843 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ERICH1Q86X53 443 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf20Q8ND61 904 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC4Q96A65 974 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC45Q96CN5 670 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HPDLQ96IR7 371 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 OSMRQ99650 979 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CD19P15391 556 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 AXLP30530 894 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TAS2R40P59535 323 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 INCA1Q0VD86 236 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP58Q5T655 872 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NOTUMQ6P988 496 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TTC39CQ8N584 583 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SLCO2A1Q92959 643 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KIF12Q96FN5 646 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TWNKQ96RR1 684 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RUFY1Q96T51 708 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DPH5Q9H2P9 285 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GINS2Q9Y248 185 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 O00370 1275 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GJB6O95452 261 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 INHAP05111 366 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HOXC8P31273 242 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GBP1P32455 592 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM32Q13049 653 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 EXD1Q8NHP7 514 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SNX27Q96L92 541 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SNTG2Q9NY99 539 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TREHO43280 583 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MYL3P08590 195 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 VDRP11473 427 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms