RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	GABRD	O14764	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PRDX5	P30044	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	CYP2D6	P10635	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	CYP2C19	P33261	490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	USP37	Q86T82	979 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	EPHB2	P29323	1055 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	LIPA	P38571	399 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TCF15	Q12870	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MAPK7	Q13164	816 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	KIF22	Q14807	665 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TNKS	O95271	1327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268		H0YIZ8	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	KATNA1	O75449	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	RARB	P10826	455 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	NDUFB7	P17568	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	ITGAL	P20701	1170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CD6	P30203	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65	4e-6	■■■■□ 19.5
USP34-222	ENST00000498268	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	ZNF134	P52741	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	ITK	Q08881	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	PPP6C	O00743	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	MOSPD3	O75425	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	JTB	O76095	146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CLSTN1	O94985	981 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CHEK2	O96017	543 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	AHSG	P02765	367 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	GNAI3	P08754	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CYP2C18	P33260	490 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	EVA1C	P58658	441 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	GNAI1	P63096	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	DCLK1	O15075	740 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CTGF	P29279	349 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	CLCN2	P51788	898 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	TUBA4A	P68366	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-222	ENST00000498268	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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