RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KIF13AQ9H1H9 1805 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 DIP2BQ9P265 1576 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TNIKQ9UKE5 1360 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 HSPA6P17066 643 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NDUFV1P49821 464 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MAP2K6P52564 334 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FAM153CQ494X1 144 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 LAYNQ6UX15 382 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ALG8Q9BVK2 526 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 RAD54BQ9Y620 910 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 COX11Q9Y6N1 276 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PTPRGP23470 1445 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MARCH6O60337 910 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PPP3CBP16298 524 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GATA3P23771 443 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GRIA3P42263 894 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KCNJ5P48544 419 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 EPHB1P54762 984 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SOX10P56693 466 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SLC35A4Q96G79 324 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 UROC1Q96N76 676 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NELL2Q99435 816 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ABCC2Q92887 1545 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 IQGAP2Q13576 1575 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 E9PLN8 166 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 M0QYG6 137 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ABLIM3O94929 683 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MATN4O95460 622 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CD6P30203 668 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PHKA1P46020 1223 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MC2RQ01718 297 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 USP37Q86T82 979 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 LPIN2Q92539 896 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 HPS3Q969F9 1004 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KLC4Q9NSK0 619 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GLI2P10070 1586 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KDM6BO15054 1643 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NXPH3O95157 252 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CHRM2P08172 466 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GPD1P21695 349 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 EMC10Q5UCC4 262 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TFAP2BQ92481 460 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PBKQ96KB5 322 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 AIFM3Q96NN9 605 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ETAA1Q9NY74 926 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms