RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.76□□□□□ -1.49
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HESX1Q9UBX0 185 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED16Q9Y2X0 877 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAD54BQ9Y620 910 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR27A2RRH5 827 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MGST3O14880 152 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNC5CO95185 931 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPR1P16066 1061 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MLC1Q15049 377 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGBD1Q96JS3 809 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.75□□□□□ -1.49
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