RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 TDP1Q9NUW8 608 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 EML5Q05BV3 1969 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TRIP11Q15643 1979 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 M0QZQ0 153 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SOAT2O75908 522 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ODC1P11926 461 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GJA4P35212 333 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 HOXD12P35452 270 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KRT2P35908 639 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 IFNAR2P48551 515 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SEC13P55735 322 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 STK3Q13188 491 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SEMA3BQ13214 749 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CENPPQ6IPU0 288 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PIP4P1Q86T03 277 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CEP76Q8TAP6 659 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 WHAMMQ8TF30 809 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PI4KAP42356 2102 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BPTFQ12830 3046 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 AP5Z1O43299 807 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CDC45O75419 566 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 VNN2O95498 520 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SYPP08247 313 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TYMPP19971 482 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PEX3P56589 373 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 EVCP57679 992 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 STRN3Q13033 797 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MTF1Q14872 753 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 C2orf27AQ580R0 203 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RASSF3Q86WH2 238 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 METTL23Q86XA0 190 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PGBD3Q8N328 593 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ADAM32Q8TC27 787 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 OXER1Q8TDS5 423 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GIPC2Q8TF65 315 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RLN3Q8WXF3 142 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 WASF1Q92558 559 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ECT2Q9H8V3 914 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TBX20Q9UMR3 447 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CCL26Q9Y258 94 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RAXQ9Y2V3 346 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 STK24Q9Y6E0 443 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CITO14578 2027 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MED24O75448 989 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 LARGE1O95461 756 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NFATC1O95644 943 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CKMP06732 381 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SERPINF2P08697 491 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.67□□□□□ -1.34
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