RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494984.5

QARS-223, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene QARS, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-223	ENST00000494984	NLRP12	P59046	1061 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CLDN10	P78369	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	NTHL1	P78549	312 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CYP27A1	Q02318	531 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	DUSP4	Q13115	394 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GPR17	Q13304	367 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	PLD1	Q13393	1074 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	VEPH1	Q14D04	833 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	TAF12	Q16514	161 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	KRT39	Q6A163	491 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GJD3	Q8N144	294 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CORO1B	Q9BR76	489 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.08	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984		A8MXQ7	604 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GNA14	O95837	355 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CD58	P19256	250 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	FSHR	P23945	695 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GTF2H1	P32780	548 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	EPHB3	P54753	998 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ORC1	Q13415	861 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CCDC142	Q17RM4	750 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CBWD6	Q4V339	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	TAF4B	Q92750	862 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	MYLPF	Q96A32	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ASAH2	Q9NR71	780 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		10.07	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ATP2C2	O75185	946 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	RHO	P08100	348 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	MYL4	P12829	197 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	LMO2	P25791	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CDH8	P55286	799 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	ENPEP	Q07075	957 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	CETN1	Q12798	172 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SMARCB1	Q12824	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	LRMP	Q12912	555 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	STX1A	Q16623	288 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
QARS-223	ENST00000494984	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.06	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms