RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
HERC4-211ENST00000492996 OATP04181 439 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ASGR1P07306 291 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GLRA2P23416 452 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NNTQ13423 1086 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 LY6KQ17RY6 165 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB33Q86T24 672 aa7.46□□□□□ -1.22
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TRPC6Q9Y210 931 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PLAAQ9Y263 795 aa7.46□□□□□ -1.22
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HERC4-211ENST00000492996 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CCDC188H7C350 402 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CES2O00748 559 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 B4GALT4O60513 344 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GGPS1O95749 300 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DRAP01903 254 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF8P28908 595 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PIK3CAP42336 1068 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GPC3P51654 580 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ALS2CLQ60I27 953 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 USP37Q86T82 979 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 IQCKQ8N0W5 287 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RUBCNQ92622 972 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CHST12Q9NRB3 414 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MAPK13O15264 365 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 EDN1P05305 212 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ECHS1P30084 290 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PPFIA1Q13136 1202 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 LRRC31Q6UY01 552 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TMC2Q8TDI7 906 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 WHAMMQ8TF30 809 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 C18orf8Q96DM3 657 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 FBXL18Q96ME1 805 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CARD9Q9H257 536 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SNX24Q9Y343 169 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PRR33A8MZF0 331 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CFHP08603 1231 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PYGMP11217 842 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GNAT1P11488 350 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GJC1P36383 396 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 KCNJ1P48048 391 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 STAT5BP51692 787 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CDR2Q01850 454 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TLE2Q04725 743 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PDCLQ13371 301 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DGKDQ16760 1214 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 WDR44Q5JSH3 913 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DPP9Q86TI2 863 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TIFAQ96CG3 184 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HVCN1Q96D96 273 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 FAM107BQ9H098 131 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 EXTL3O43909 919 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 AP1G2O75843 785 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GARTP22102 1010 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B3P37058 310 aa7.45□□□□□ -1.22
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