RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488429.5

GGTA1P-204, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene GGTA1P, Length 1,104 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-204ENST00000488429 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.01□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 HPS4Q9NQG7 708 aa9.01□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.01□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.01□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 BPTFQ12830 3046 aa9.01□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 KALRNO60229 2985 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MTMR11A4FU01 709 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CCDC169A6NNP5 214 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 UPK3BL1B0FP48 263 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 PATE3B3GLJ2 98 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MAP3K13O43283 966 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ALDH1A2O94788 518 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 REC8O95072 547 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 OR4Q2P0C623 313 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ODC1P11926 461 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 HARSP12081 509 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MUTP22033 750 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 HOXD12P35452 270 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 NR1H3Q13133 447 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ANO7Q6IWH7 933 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 DSTYKQ6XUX3 929 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CD101Q93033 1021 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ATP2A3Q93084 1043 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TDP1Q9NUW8 608 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 INVSQ9Y283 1065 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 KNTC1P50748 2209 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 FAM205CA6NFA0 338 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TNFRSF10BO14763 440 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MED24O75448 989 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 VNN2O95498 520 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ENGP17813 658 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TYMPP19971 482 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 PAX3P23760 479 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 RPA1P27694 616 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 GJA4P35212 333 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 GALK1P51570 392 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SMARCB1Q12824 385 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 STRN3Q13033 797 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 NR5A1Q13285 461 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SYT12Q8IV01 421 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CHFRQ96EP1 664 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 DRC1Q96MC2 740 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TBX20Q9UMR3 447 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.99□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 OPHN1O60890 802 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SOAT2O75908 522 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 LARGE1O95461 756 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CFIP05156 583 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ARSAP15289 507 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 CYP3A5P20815 502 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 BCKDHBP21953 392 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 PROZP22891 400 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 LRPAP1P30533 357 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 NPTX2P47972 431 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 IFNAR2P48551 515 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 PEX3P56589 373 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SEMA3BQ13214 749 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 TRIM29Q14134 588 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.98□□□□□ -0.97
GGTA1P-204ENST00000488429 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms