RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465892.6

TGFBR3-204, Transcript of transforming growth factor beta receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGFBR3, Length 2,908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3-204ENST00000465892 GAS7O60861 476 aa14.65□□□□□ -0.06
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TGFBR3-204ENST00000465892 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 GPSM2P81274 684 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 AP3B2Q13367 1082 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.65□□□□□ -0.06
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TGFBR3-204ENST00000465892 AMNQ9BXJ7 453 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 CLUHO75153 1309 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.65□□□□□ -0.06
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TGFBR3-204ENST00000465892 LSAMPQ13449 338 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 DDB1Q16531 1140 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 NFIL3Q16649 462 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 GSTA3Q16772 222 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 CENPUQ71F23 418 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 NLRX1Q86UT6 975 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 FBXO11Q86XK2 927 aa14.65□□□□□ -0.06
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TGFBR3-204ENST00000465892 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 RELL1Q8IUW5 271 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 LXNQ9BS40 222 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 GINM1Q9NU53 330 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-204ENST00000465892 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SFT2D3Q587I9 215 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 HELQQ8TDG4 1101 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 RIMBP2O15034 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 LIASO43766 372 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 CIB2O75838 187 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 FAM200BP0CF97 657 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SLC1A1P43005 524 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 NRLP54845 237 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 AP2B1P63010 937 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 NAT14Q8WUY8 206 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 MTBPQ96DY7 904 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 DENND3A2RUS2 1198 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SLC16A4O15374 487 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ZNF862O60290 1169 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SLC18A1P54219 525 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 BPIFB4P59827 614 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 NFIAQ12857 509 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 DLG1Q12959 904 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 HIF1AQ16665 826 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 BBS9Q3SYG4 887 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SESTD1Q86VW0 696 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 BANPQ8N9N5 519 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SERAC1Q96JX3 654 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.63□□□□□ -0.07
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TGFBR3-204ENST00000465892 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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TGFBR3-204ENST00000465892 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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TGFBR3-204ENST00000465892 PADI6Q6TGC4 694 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ZNF398Q8TD17 642 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 PHF12Q96QT6 1004 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 NACC1Q96RE7 527 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBR3-204ENST00000465892 ATP2A1O14983 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
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