RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 GPR17Q13304 367 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 NFIL3Q16649 462 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 SPATA20Q8TB22 786 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 NXPE3Q969Y0 559 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TIGD1Q96MW7 591 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PIDD1Q9HB75 910 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 F5P12259 2224 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 FRYLO94915 3013 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CYB561D2O14569 222 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PRRG1O14668 218 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MAPK13O15264 365 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MICAL2O94851 1124 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 SEC24AO95486 1093 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TNNC2P02585 160 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CPB1P15086 417 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ELF1P32519 619 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CYP2J2P51589 502 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 EPHA5P54756 1037 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 RBP5P82980 135 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ENPEPQ07075 957 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ADCY1Q08828 1119 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 SMARCB1Q12824 385 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MTMR3Q13615 1198 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 OR10T2Q8NGX3 314 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MYADMQ96S97 322 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CGRRF1Q99675 332 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MTMR11A4FU01 709 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ANHXE9PGG2 379 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CLIC2O15247 247 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CCL16O15467 120 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 EXOC3O60645 756 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 LRG1P02750 347 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 NR3C1P04150 777 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 LAMP2P13473 410 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 FSHRP23945 695 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 AP3M2P53677 418 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 MYO1EQ12965 1108 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PLD1Q13393 1074 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 WSCD1Q658N2 575 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CENPPQ6IPU0 288 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 DPH6Q7L8W6 267 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 METTL23Q86XA0 190 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 LEMD2Q8NC56 503 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 GSDMAQ96QA5 445 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 FNBP1Q96RU3 617 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 CDH7Q9ULB5 785 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 L1RE1Q9UN81 338 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 YIPF1Q9Y548 306 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00963-204ENST00000427778 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms