RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 OBP2AQ9NY56 170 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CDC25CP30307 473 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA18Q8TC71 538 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CHRDQ9H2X0 955 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GPD1LQ8N335 351 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 FAM3CQ92520 227 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 L1RE1Q9UN81 338 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 FRYLO94915 3013 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CUTAO60888 179 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 TSPY1Q01534 308 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GPR158Q5T848 1215 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 YAF2Q8IY57 180 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ACBD6Q9BR61 282 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 TASP1Q9H6P5 420 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 SIX4Q9UIU6 781 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 KINO60870 393 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PRAMEF12O95522 483 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 HOXD13P35453 343 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 MTAPQ13126 283 aa22.41■■□□□ 1.18
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UBXN4-204ENST00000426921 SHC4Q6S5L8 630 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 GCNAQ96QF7 691 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PKMYT1Q99640 499 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ABCB6Q9NP58 842 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 HUS1O60921 280 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 LILRB5O75023 590 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 RBP5P82980 135 aa22.4■■□□□ 1.18
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UBXN4-204ENST00000426921 AMPD3Q01432 767 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.4■■□□□ 1.18
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UBXN4-204ENST00000426921 IQUBQ8NA54 791 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 HPS3Q969F9 1004 aa22.4■■□□□ 1.18
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UBXN4-204ENST00000426921 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN4-204ENST00000426921 INTS13Q9NVM9 706 aa22.4■■□□□ 1.18
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UBXN4-204ENST00000426921 PTPRJQ12913 1337 aa22.39■■□□□ 1.18
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UBXN4-204ENST00000426921 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.39■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 TDGF1P13385 188 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CCNE1P24864 410 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CDR1P51861 262 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 EHHADHQ08426 723 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 BFSP1Q12934 665 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SURF1Q15526 300 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.39■■□□□ 1.17
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