RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409286.5

LIMS2-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMS2, Length 1,678 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2-204ENST00000409286 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 GJB6O95452 261 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 HOXC8P31273 242 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 CETN2P41208 172 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 GYS2P54840 703 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SGO2Q562F6 1265 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TWNKQ96RR1 684 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 PARP2Q9UGN5 583 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 USTQ9Y2C2 406 aa20.49■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TREHO43280 583 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 AKR1A1P14550 325 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 BEX3Q00994 111 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 BEST2Q8NFU1 509 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 MCEEQ96PE7 176 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 CNTN3Q9P232 1028 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 MICAL2O94851 1124 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 CRHR2Q13324 411 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SNX17Q15036 470 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS2-204ENST00000409286 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS2-204ENST00000409286 PASKQ96RG2 1323 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 ECEL1O95672 775 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 HSD17B3P37058 310 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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LIMS2-204ENST00000409286 NDST1P52848 882 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.47■□□□□ 0.87
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LIMS2-204ENST00000409286 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 C7orf31Q8N865 590 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.47■□□□□ 0.87
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LIMS2-204ENST00000409286 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 FMO2Q99518 471 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 SNX24Q9Y343 169 aa20.47■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 O00370 1275 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 KRT3P12035 628 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 COPS2P61201 443 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 DCLK3Q9C098 648 aa20.46■□□□□ 0.87
LIMS2-204ENST00000409286 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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LIMS2-204ENST00000409286 PPFIA2O75334 1257 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.45■□□□□ 0.86
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LIMS2-204ENST00000409286 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 FLT3P36888 993 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 GPD2P43304 727 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 OGDHQ02218 1023 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 ORC1Q13415 861 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 XYLT1Q86Y38 959 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 MIS12Q9H081 205 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 SYNCQ9H7C4 482 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS2-204ENST00000409286 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.45■□□□□ 0.86
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