RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396779.7

TIMM17B-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 1,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-202ENST00000396779 MED15Q96RN5 788 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SNX25Q9H3E2 840 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PIDD1Q9HB75 910 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ANO10Q9NW15 660 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.39■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 XYLBO75191 536 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 STX1AQ16623 288 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 TRIM59Q8IWR1 403 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 TMEM209Q96SK2 561 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 RAB20Q9NX57 234 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.38■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 MTMR11A4FU01 709 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SEC24AO95486 1093 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 LRG1P02750 347 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 POU2F2P09086 479 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 FMO5P49326 533 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CETN1Q12798 172 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CBWD6Q4V339 395 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 WDR44Q5JSH3 913 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 OSTM1Q86WC4 334 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 FAXDC2Q96IV6 333 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 THAP9Q9H5L6 903 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CDH9Q9ULB4 789 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 POLIQ9UNA4 740 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.37■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PMM2O15305 246 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 WEE2P0C1S8 567 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 DUSP4Q13115 394 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SYT15Q9BQS2 421 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.36■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 P4HA2O15460 535 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CCL16O15467 120 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 VNN2O95498 520 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PDGFRBP09619 1106 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 LMO2P25791 158 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 KCNH2Q12809 1159 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PLD1Q13393 1074 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ELMOD1Q8N336 334 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SEMA4DQ92854 862 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 BCO2Q9BYV7 579 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 POMKQ9H5K3 350 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CYP3A43Q9HB55 503 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CD320Q9NPF0 282 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CDH22Q9UJ99 828 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 A8MXQ7 604 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 AFPP02771 609 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ASPAP45381 313 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ALDH1A3P47895 512 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CDH8P55286 799 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 IRF2BP1Q8IU81 584 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PKMYT1Q99640 499 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ABCB6Q9NP58 842 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 NR2E1Q9Y466 385 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 YIPF1Q9Y548 306 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 CLUHO75153 1309 aa18.33■□□□□ 0.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PTPN2P17706 415 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms