RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 VDRP11473 427 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 BCAR1P56945 870 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA1328Q86T90 577 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SLC9A7Q96T83 725 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 GJB5O95377 273 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TYMPP19971 482 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 MAGEA1P43355 309 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SGO2Q562F6 1265 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ACOT1Q86TX2 421 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CWH43Q9H720 699 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PDGFRBP09619 1106 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 GZMAP12544 262 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 STILQ15468 1287 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 OSTM1Q86WC4 334 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TFAP2BQ92481 460 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 NENFQ9UMX5 172 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CEP83Q9Y592 693 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 LMO2P25791 158 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PCSK1P29120 753 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 VAV2P52735 878 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PALB2Q86YC2 1186 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 MARCH5Q9NX47 278 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 NME7Q9Y5B8 376 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CEP290O15078 2479 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ATP8B3O60423 1300 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SYN3O14994 580 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 LAG3P18627 525 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF558Q96NG5 402 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 INSL6Q9Y581 213 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PBX3P40426 434 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CNGA2Q16280 664 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 FUT10Q6P4F1 479 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CDH9Q9ULB4 789 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 USP27XA6NNY8 438 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 O00370 1275 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 HCRTO43612 131 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 RTN2O75298 545 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 H2AFZP0C0S5 128 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 KIF5AQ12840 1032 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 H2AFVQ71UI9 128 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 PASD1Q8IV76 773 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 C12orf29Q8N999 325 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SYT15Q9BQS2 421 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 INTUQ9ULD6 942 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 RAD9AQ99638 391 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 ACBD6Q9BR61 282 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.07■□□□□ 0.8
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