RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367094.6

TULP4-201, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP4, Length 5,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-201ENST00000367094 ZNF235Q14590 738 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 VEPH1Q14D04 833 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 LRRC14Q15048 493 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TMEM259Q4ZIN3 620 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 NOTUMQ6P988 496 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 APBB2Q92870 758 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ATG4CQ96DT6 458 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.65□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 A0A087X0T9 212 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 GOLGA8RI6L899 631 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 DIAPH2O60879 1101 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 KLHL2O95198 593 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 FAM228BP0C875 321 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ITGA8P53708 1063 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HERVK_113P62684 666 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ZNF507Q8TCN5 953 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 DEFB129Q9H1M3 183 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SELENONQ9NZV5 590 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HACL1Q9UJ83 578 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 WDR47O94967 919 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 OAZ1P54368 228 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TAGAPQ8N103 731 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 PI4K2BG5E9Z4 385 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 IRAK1P51617 712 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 PDK2Q15119 407 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 PTGISQ16647 500 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 DGKDQ16760 1214 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 FAM161BQ96MY7 647 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 FUT8Q9BYC5 575 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 STX3Q13277 289 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 CCNYL1Q8N7R7 359 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 AFG1LQ8WV93 481 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 CCDC90BQ9GZT6 254 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 GGA3Q9NZ52 723 aa10.64□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 E5RI56 91 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 VDRP11473 427 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TCF3P15923 654 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HSD17B3P37058 310 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HIC1Q14526 733 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 DNERQ8NFT8 737 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 FOPNLQ96NB1 174 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 MRIQ9BWK5 157 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 THAP2Q9H0W7 228 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 F8VZ95 297 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 SLC15A2Q16348 729 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 LONRF1Q17RB8 773 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 EXT2Q93063 718 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 IDI2Q9BXS1 227 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 RUBCNLQ9H714 662 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 MLXIPLQ9NP71 852 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ZNF229Q9UJW7 825 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 RASSF9O75901 435 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 HOXC6P09630 235 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 RALBP11234 206 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 PTK7Q13308 1070 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 POTEAQ6S8J7 498 aa10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TULP4-201ENST00000367094 WDR49Q8IV35 697 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms