RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 KLK14Q9P0G3 267 aa21.49■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 C2CD2LO14523 706 aa21.49■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 CUL2Q13617 745 aa21.49■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.49■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.49■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 USP33Q8TEY7 942 aa21.48■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 NOD2Q9HC29 1040 aa21.48■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF711Q9Y462 761 aa21.48■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 PHF2O75151 1096 aa21.47■■□□□ 1.03
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NCKAP1-201ENST00000360982 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.035e-11■■■■■ 47.5
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NCKAP1-201ENST00000360982 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.47■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.47■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 CKMP06732 381 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 KCNA1Q09470 495 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 WASHC5Q12768 1159 aa21.46■■□□□ 1.03
NCKAP1-201ENST00000360982 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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