RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335046.7

UBE2C-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 737 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-202ENST00000335046 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 CETN1Q12798 172 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 STX1AQ16623 288 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 SNX25Q9H3E2 840 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 CDH9Q9ULB4 789 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 WDR44Q5JSH3 913 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 OSTM1Q86WC4 334 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 TMEM209Q96SK2 561 aa23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
UBE2C-202ENST00000335046 MTMR11A4FU01 709 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SEC24AO95486 1093 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 LRG1P02750 347 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 FMO5P49326 533 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PLD1Q13393 1074 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CBWD6Q4V339 395 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PIDD1Q9HB75 910 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 POLIQ9UNA4 740 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 BCO2Q9BYV7 579 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 LMO2P25791 158 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 KCNH2Q12809 1159 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 DUSP4Q13115 394 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 FAM171BQ6P995 826 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ELMOD1Q8N336 334 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 TTC39CQ8N584 583 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SEMA4DQ92854 862 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SYT15Q9BQS2 421 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ABCB6Q9NP58 842 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 A8MXQ7 604 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 VNN2O95498 520 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ASPAP45381 313 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ALDH1A3P47895 512 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 UNC93AQ86WB7 457 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.375e-10■■□□□ 12.3
UBE2C-202ENST00000335046 TNIP3Q96KP6 325 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PKMYT1Q99640 499 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 POMKQ9H5K3 350 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CCL16O15467 120 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PDGFRBP09619 1106 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 WEE2P0C1S8 567 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CDH8P55286 799 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 TYRO3Q06418 890 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 USTQ9Y2C2 406 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 NR2E1Q9Y466 385 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 YIPF1Q9Y548 306 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 ASB3Q9Y575 518 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 PTPN2P17706 415 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 EPHB3P54753 998 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 TWF1Q12792 350 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 IQCEQ6IPM2 695 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-202ENST00000335046 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms