RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RAB2AP61019 212 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRB-202ENST00000334414 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MNTQ99583 582 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 EHD1Q9H4M9 534 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 DYRK4Q9NR20 520 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
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PTPRB-202ENST00000334414 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ACLYP53396 1101 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRB-202ENST00000334414 IDH3BO43837 385 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRB-202ENST00000334414 USP11P51784 963 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 KYQ8NBH2 561 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 VTA1Q9NP79 307 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ITM2BQ9Y287 266 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.74□□□□□ -1.49
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