RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CDH9Q9ULB4 789 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 EYSQ5T1H1 3165 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TBX10O75333 385 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CDH8P55286 799 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TTC39CQ8N584 583 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LMO3Q8TAP4 145 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TATDN2Q93075 761 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 MSLNLQ96KJ4 702 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM209Q96SK2 561 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 A8MXQ7 604 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 PDGFRBP09619 1106 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 OR4Q2P0C623 313 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LMO2P25791 158 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 AAK1Q2M2I8 961 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A12Q504Y0 691 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 MIIPQ5JXC2 388 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LIN9Q5TKA1 542 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 GBP6Q6ZN66 633 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TCEAL8Q8IYN2 117 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 NT5C1BQ96P26 610 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 DNAI2Q9GZS0 605 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SFXN1Q9H9B4 322 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 THEGQ9P2T0 379 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CD207Q9UJ71 328 aa28.6■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 WEE2P0C1S8 567 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF18P17022 549 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ITIH3Q06033 890 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY1Q08828 1119 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 IQCB1Q15051 598 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LRRTM3Q86VH5 581 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 UNC93AQ86WB7 457 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SDCBP2Q9H190 292 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 HSFX1Q9UBD0 423 aa28.59■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC10BA6NIK2 292 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYND10O75800 440 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 KRT31Q15323 416 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SYCE2Q6PIF2 218 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LRSAM1Q6UWE0 723 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TNIP3Q96KP6 325 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SYT15Q9BQS2 421 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CYP4F11Q9HBI6 524 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 H3BQ06 376 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PES1O00541 588 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PRRG1O14668 218 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 RAP1GAPP47736 663 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 TPM4P67936 248 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PPM1LQ5SGD2 360 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 CES5AQ6NT32 575 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 FAM171BQ6P995 826 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 CYP26C1Q6V0L0 522 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 SPPL2BQ8TCT7 592 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 S1PR5Q9H228 398 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 HSD3B7Q9H2F3 369 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 CBX8Q9HC52 389 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 GCNT4Q9P109 453 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 MTMR11A4FU01 709 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 C8AP07357 584 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA9P31269 272 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 INCA1Q0VD86 236 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 LRMPQ12912 555 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 SLC7A14Q8TBB6 771 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 FAM81BQ96LP2 452 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PGLYRP2Q96PD5 576 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PKMYT1Q99640 499 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 VPS16Q9H269 839 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 PAPLNO95428 1278 aa28.55■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 SEC24AO95486 1093 aa28.55■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 NDST1P52848 882 aa28.55■■■□□ 2.16
CRIP1-201ENST00000330233 CUL2Q13617 745 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms