RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CPA4Q9UI42 421 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 C2CD2Q9Y426 696 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 NUDT17P0C025 328 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CALCOCO2Q13137 446 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 PTK6Q13882 451 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ATL2Q8NHH9 583 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CCDC114Q96M63 670 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 DPP3Q9NY33 737 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 WHRNQ9P202 907 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GINS2Q9Y248 185 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KAT6AQ92794 2004 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SHBGP04278 402 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 IVLP07476 585 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 PDCLQ13371 301 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CCNG2Q16589 344 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KRT71Q3SY84 523 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 LRRC38Q5VT99 294 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GAS8O95995 478 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KRT1P04264 644 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 P4HA1P13674 534 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GRM5P41594 1212 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 DENND2CQ68D51 928 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CPXM1Q96SM3 734 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KRT10P13645 584 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 IVDP26440 423 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 RBP5P82980 135 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ADCY2Q08462 1091 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KIF12Q96FN5 646 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 RRAGCQ9HB90 399 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 A6NJR5 290 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 MICAL2O94851 1124 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KRT3P12035 628 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CETN2P41208 172 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SLC29A2Q14542 456 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SLMAPQ14BN4 828 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SNF8Q96H20 258 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 A6NNZ2 444 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 NPTXRO95502 500 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ITIH2P19823 946 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 MORN1Q5T089 497 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 KAZNQ674X7 775 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 CITO14578 2027 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX18-201ENST00000326277 GPR32O75388 356 aa24.15■■□□□ 1.46
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