RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289175.10

LRRFIP1-202, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRFIP1, Length 3,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1-202ENST00000289175 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 SARM1Q6SZW1 724 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 CACUL1Q86Y37 369 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 TFAP2BQ92481 460 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 AGPAT1Q99943 283 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRFIP1-202ENST00000289175 LCHNA4D1U4 455 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 F8VP50 259 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 LILRA4P59901 499 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.028e-10■□□□□ 11
LRRFIP1-202ENST00000289175 MS4A14Q96JA4 679 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SIX4Q9UIU6 781 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ENDOD1O94919 500 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 FERP16591 822 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 TSPY1Q01534 308 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 DCAF6Q58WW2 860 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CDH22Q9UJ99 828 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 L1RE1Q9UN81 338 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 DAPK3O43293 454 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CREB3O43889 395 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PALMO75781 387 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 EPHB4P54760 987 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 WDR49Q8IV35 697 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 VPS52Q8N1B4 723 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 KIF18AQ8NI77 898 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CARD6Q9BX69 1037 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CENPHQ9H3R5 247 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 MYO1FO00160 1098 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PTGESO14684 152 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 NRP1O14786 923 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 TACC1O75410 805 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 NEBLO76041 1014 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SERPING1P05155 500 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CA3P07451 260 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PBX2P40425 430 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PRMT2P55345 433 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 MTMR3Q13615 1198 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 AADACL2Q6P093 401 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 NME8Q8N427 588 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 STK33Q9BYT3 514 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 HAS3O00219 553 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 B4GALT3O60512 393 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 USP17L7P0C7H9 530 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 KLRC2P26717 231 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 FPGSQ05932 587 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 NOX5Q96PH1 765 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 NUP85Q9BW27 656 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SDCBP2Q9H190 292 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 NAGPAQ9UK23 515 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 TCTN1Q2MV58 587 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 WDR59Q6PJI9 974 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC4A1P02730 911 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 GRM5P41594 1212 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ADCY1Q08828 1119 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ING5Q8WYH8 240 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 CCDC114Q96M63 670 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 SYT15Q9BQS2 421 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRFIP1-202ENST00000289175 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms