RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A27O95847 323 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 APOA4P06727 396 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GZMAP12544 262 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 RARGP13631 454 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PTGER2P43116 358 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC3Q13217 504 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CHI3L2Q15782 390 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 EPC2Q52LR7 807 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF263O14978 683 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PTK6Q13882 451 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM154Q6P9G4 183 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 NUP93Q8N1F7 819 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MDM1Q8TC05 714 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ITIH4Q14624 930 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC6Q86X45 466 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 RNF181Q9P0P0 153 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CYBBP04839 570 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1E1P36543 226 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA5P30532 468 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FDFT1P37268 417 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HPDLQ96IR7 371 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 WHRNQ9P202 907 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.04■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF6Q58WW2 860 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CCNJLQ8IV13 435 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DPA1P20036 260 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 VHLP40337 213 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MTFR1Q15390 333 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CENPPQ6IPU0 288 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00523Q86TU6 105 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ELP3Q9H9T3 547 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRMP28827 1452 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC78A2IDD5 438 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA4P41247 253 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TEKT4Q8WW24 435 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DYRK4Q9NR20 520 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.03■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D4O60343 1298 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 RGS4P49798 205 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MROH9Q5TGP6 573 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 IFNEQ86WN2 208 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 UBA3Q8TBC4 463 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 NOD2Q9HC29 1040 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 COPAP53621 1224 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SNX17Q15036 470 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ACADSP16219 412 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.02■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CHD1O14646 1710 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PJA2O43164 708 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DMC1Q14565 340 aa22.01■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms